Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI54

PRO0628, Putative uncharacterized protein PRO0628, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO0628Q9UI54 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRO0628Q9UI54 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRO0628Q9UI54 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRO0628Q9UI54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRO0628Q9UI54 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRO0628Q9UI54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRO0628Q9UI54 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms