Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PFDN2Q9UHV9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PFDN2Q9UHV9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN2Q9UHV9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN2Q9UHV9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN2Q9UHV9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms