Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DPM3Q9P2X0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DPM3Q9P2X0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DPM3Q9P2X0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DPM3Q9P2X0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DPM3Q9P2X0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DPM3Q9P2X0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DPM3Q9P2X0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DPM3Q9P2X0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DPM3Q9P2X0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPM3Q9P2X0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DPM3Q9P2X0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPM3Q9P2X0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms