Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC57.66■■■■■ 6.82
CCDC180Q9P1Z9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.66■■■■■ 6.82
CCDC180Q9P1Z9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC57.66■■■■■ 6.82
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.64■■■■■ 6.82
CCDC180Q9P1Z9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC57.61■■■■■ 6.81
CCDC180Q9P1Z9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.61■■■■■ 6.81
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.61■■■■■ 6.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC57.6■■■■■ 6.81
CCDC180Q9P1Z9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.58■■■■■ 6.81
CCDC180Q9P1Z9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC57.58■■■■■ 6.81
CCDC180Q9P1Z9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC57.55■■■■■ 6.8
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.54■■■■■ 6.8
CCDC180Q9P1Z9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC57.53■■■■■ 6.8
CCDC180Q9P1Z9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC57.51■■■■■ 6.8
CCDC180Q9P1Z9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC57.5■■■■■ 6.8
CCDC180Q9P1Z9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC57.5■■■■■ 6.79
CCDC180Q9P1Z9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.48■■■■■ 6.79
CCDC180Q9P1Z9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC57.47■■■■■ 6.79
CCDC180Q9P1Z9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.44■■■■■ 6.79
CCDC180Q9P1Z9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC57.43■■■■■ 6.78
CCDC180Q9P1Z9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC57.43■■■■■ 6.78
CCDC180Q9P1Z9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.39■■■■■ 6.78
CCDC180Q9P1Z9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.36■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC57.36■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.35■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.34■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.33■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC57.32■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC57.32■■■■■ 6.77
CCDC180Q9P1Z9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC57.3■■■■■ 6.76
CCDC180Q9P1Z9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC57.27■■■■■ 6.76
CCDC180Q9P1Z9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.27■■■■■ 6.76
CCDC180Q9P1Z9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.26■■■■■ 6.76
CCDC180Q9P1Z9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC57.25■■■■■ 6.76
CCDC180Q9P1Z9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC57.25■■■■■ 6.75
CCDC180Q9P1Z9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC57.24■■■■■ 6.75
CCDC180Q9P1Z9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.21■■■■■ 6.75
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC57.19■■■■■ 6.75
CCDC180Q9P1Z9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.19■■■■■ 6.75
CCDC180Q9P1Z9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.18■■■■■ 6.74
CCDC180Q9P1Z9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC57.18■■■■■ 6.74
CCDC180Q9P1Z9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.17■■■■■ 6.74
CCDC180Q9P1Z9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC57.17■■■■■ 6.74
CCDC180Q9P1Z9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.12■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC57.12■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC57.1■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.09■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC57.08■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.08■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC57.07■■■■■ 6.73
CCDC180Q9P1Z9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC57.05■■■■■ 6.72
CCDC180Q9P1Z9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC57.04■■■■■ 6.72
CCDC180Q9P1Z9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.01■■■■■ 6.72
CCDC180Q9P1Z9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC57■■■■■ 6.72
CCDC180Q9P1Z9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC56.99■■■■■ 6.71
CCDC180Q9P1Z9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.99■■■■■ 6.71
CCDC180Q9P1Z9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC56.97■■■■■ 6.71
CCDC180Q9P1Z9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.96■■■■■ 6.71
CCDC180Q9P1Z9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC56.95■■■■■ 6.71
CCDC180Q9P1Z9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC56.92■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC56.92■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.91■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC56.91■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC56.91■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC56.89■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.88■■■■■ 6.7
CCDC180Q9P1Z9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.85■■■■■ 6.69
CCDC180Q9P1Z9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.85■■■■■ 6.69
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC56.85■■■■■ 6.69
CCDC180Q9P1Z9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.84■■■■■ 6.69
CCDC180Q9P1Z9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.83■■■■■ 6.69
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC56.82■■■■■ 6.69
CCDC180Q9P1Z9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.81■■■■■ 6.68
CCDC180Q9P1Z9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.79■■■■■ 6.68
CCDC180Q9P1Z9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC56.79■■■■■ 6.68
CCDC180Q9P1Z9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC56.77■■■■■ 6.68
CCDC180Q9P1Z9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC56.77■■■■■ 6.68
CCDC180Q9P1Z9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.76■■■■■ 6.68
CCDC180Q9P1Z9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC56.7■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.7■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC56.7■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC56.7■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC56.7■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC56.69■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC56.69■■■■■ 6.67
CCDC180Q9P1Z9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC56.67■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC56.66■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC56.66■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.65■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC56.64■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC56.63■■■■■ 6.66
CCDC180Q9P1Z9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.61■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC56.59■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC56.59■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.59■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.57■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC56.56■■■■■ 6.65
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC56.56■■■■■ 6.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms