Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PKD2L1Q9P0L9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2L1Q9P0L9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PKD2L1Q9P0L9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2L1Q9P0L9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2L1Q9P0L9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PKD2L1Q9P0L9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2L1Q9P0L9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2L1Q9P0L9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PKD2L1Q9P0L9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PKD2L1Q9P0L9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms