Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOBEC3GQ9HC16 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBEC3GQ9HC16 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3GQ9HC16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3GQ9HC16 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3GQ9HC16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3GQ9HC16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBEC3GQ9HC16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBEC3GQ9HC16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBEC3GQ9HC16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3GQ9HC16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3GQ9HC16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3GQ9HC16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3GQ9HC16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3GQ9HC16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms