Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MVB12BQ9H7P6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MVB12BQ9H7P6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MVB12BQ9H7P6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MVB12BQ9H7P6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MVB12BQ9H7P6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MVB12BQ9H7P6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MVB12BQ9H7P6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MVB12BQ9H7P6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MVB12BQ9H7P6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MVB12BQ9H7P6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MVB12BQ9H7P6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MVB12BQ9H7P6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MVB12BQ9H7P6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms