Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTBN4Q9H254 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTBN4Q9H254 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBN4Q9H254 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBN4Q9H254 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN4Q9H254 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN4Q9H254 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTBN4Q9H254 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN4Q9H254 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTBN4Q9H254 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms