Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL25A1Q9BXS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL25A1Q9BXS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COL25A1Q9BXS0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL25A1Q9BXS0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL25A1Q9BXS0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL25A1Q9BXS0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL25A1Q9BXS0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL25A1Q9BXS0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL25A1Q9BXS0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL25A1Q9BXS0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms