Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PYGO2Q9BRQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PYGO2Q9BRQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PYGO2Q9BRQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PYGO2Q9BRQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PYGO2Q9BRQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PYGO2Q9BRQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PYGO2Q9BRQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PYGO2Q9BRQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PYGO2Q9BRQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms