Protein–RNA interactions for Protein: Q99909

SSX3, Protein SSX3, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX3Q99909 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX3Q99909 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX3Q99909 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX3Q99909 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX3Q99909 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX3Q99909 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX3Q99909 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms