Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.97■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
LMTK3Q96Q04 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
LMTK3Q96Q04 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
LMTK3Q96Q04 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
LMTK3Q96Q04 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
LMTK3Q96Q04 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LMTK3Q96Q04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
LMTK3Q96Q04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
LMTK3Q96Q04 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
LMTK3Q96Q04 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LMTK3Q96Q04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
LMTK3Q96Q04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
LMTK3Q96Q04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
LMTK3Q96Q04 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
LMTK3Q96Q04 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
LMTK3Q96Q04 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
LMTK3Q96Q04 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
LMTK3Q96Q04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LMTK3Q96Q04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LMTK3Q96Q04 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
LMTK3Q96Q04 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
LMTK3Q96Q04 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LMTK3Q96Q04 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
LMTK3Q96Q04 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.58■■■■■ 4.09
LMTK3Q96Q04 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
LMTK3Q96Q04 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
LMTK3Q96Q04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
LMTK3Q96Q04 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
LMTK3Q96Q04 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
LMTK3Q96Q04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
LMTK3Q96Q04 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
LMTK3Q96Q04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LMTK3Q96Q04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
LMTK3Q96Q04 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
LMTK3Q96Q04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LMTK3Q96Q04 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
LMTK3Q96Q04 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LMTK3Q96Q04 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LMTK3Q96Q04 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
LMTK3Q96Q04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LMTK3Q96Q04 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LMTK3Q96Q04 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
LMTK3Q96Q04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
LMTK3Q96Q04 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
LMTK3Q96Q04 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
LMTK3Q96Q04 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
LMTK3Q96Q04 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
LMTK3Q96Q04 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
LMTK3Q96Q04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LMTK3Q96Q04 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LMTK3Q96Q04 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
LMTK3Q96Q04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
LMTK3Q96Q04 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms