Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ANKRD27Q96NW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ANKRD27Q96NW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD27Q96NW4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD27Q96NW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ANKRD27Q96NW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD27Q96NW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ANKRD27Q96NW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD27Q96NW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms