Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECHDC3Q96DC8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECHDC3Q96DC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECHDC3Q96DC8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECHDC3Q96DC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ECHDC3Q96DC8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECHDC3Q96DC8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECHDC3Q96DC8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ECHDC3Q96DC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms