Protein–RNA interactions for Protein: Q96D96

HVCN1, Voltage-gated hydrogen channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1Q96D96 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
HVCN1Q96D96 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HVCN1Q96D96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HVCN1Q96D96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HVCN1Q96D96 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HVCN1Q96D96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HVCN1Q96D96 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HVCN1Q96D96 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HVCN1Q96D96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HVCN1Q96D96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HVCN1Q96D96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HVCN1Q96D96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HVCN1Q96D96 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HVCN1Q96D96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HVCN1Q96D96 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HVCN1Q96D96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HVCN1Q96D96 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms