Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APH1AQ96BI3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APH1AQ96BI3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APH1AQ96BI3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APH1AQ96BI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1AQ96BI3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APH1AQ96BI3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APH1AQ96BI3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms