Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCN9Q8WX39 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCN9Q8WX39 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCN9Q8WX39 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCN9Q8WX39 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LCN9Q8WX39 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCN9Q8WX39 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN9Q8WX39 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCN9Q8WX39 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms