Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.34■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
ABCA10Q8WWZ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
ABCA10Q8WWZ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ABCA10Q8WWZ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
ABCA10Q8WWZ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC46.28■■■■■ 5
ABCA10Q8WWZ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
ABCA10Q8WWZ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
ABCA10Q8WWZ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.24■■■■■ 4.99
ABCA10Q8WWZ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
ABCA10Q8WWZ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ABCA10Q8WWZ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
ABCA10Q8WWZ4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
ABCA10Q8WWZ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.11■■■■■ 4.97
ABCA10Q8WWZ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCA10Q8WWZ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
ABCA10Q8WWZ4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCA10Q8WWZ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCA10Q8WWZ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC46.06■■■■■ 4.96
ABCA10Q8WWZ4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
ABCA10Q8WWZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
ABCA10Q8WWZ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
ABCA10Q8WWZ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.94■■■■■ 4.94
ABCA10Q8WWZ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ABCA10Q8WWZ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
ABCA10Q8WWZ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ABCA10Q8WWZ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
ABCA10Q8WWZ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
ABCA10Q8WWZ4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCA10Q8WWZ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCA10Q8WWZ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCA10Q8WWZ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
ABCA10Q8WWZ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCA10Q8WWZ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCA10Q8WWZ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
ABCA10Q8WWZ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
ABCA10Q8WWZ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ABCA10Q8WWZ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCA10Q8WWZ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
ABCA10Q8WWZ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
ABCA10Q8WWZ4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
ABCA10Q8WWZ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCA10Q8WWZ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
ABCA10Q8WWZ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
ABCA10Q8WWZ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCA10Q8WWZ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms