Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD5

RNF141, RING finger protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF141Q8WVD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF141Q8WVD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF141Q8WVD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF141Q8WVD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF141Q8WVD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF141Q8WVD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF141Q8WVD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms