Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC29Q8WV35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC29Q8WV35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC29Q8WV35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC29Q8WV35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC29Q8WV35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC29Q8WV35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC29Q8WV35 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC29Q8WV35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC29Q8WV35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC29Q8WV35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC29Q8WV35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC29Q8WV35 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms