Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf54Q8N8G6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C15orf54Q8N8G6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf54Q8N8G6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C15orf54Q8N8G6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf54Q8N8G6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf54Q8N8G6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C15orf54Q8N8G6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf54Q8N8G6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms