Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A8Q8N695 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A8Q8N695 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A8Q8N695 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A8Q8N695 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A8Q8N695 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC5A8Q8N695 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC5A8Q8N695 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC5A8Q8N695 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A8Q8N695 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A8Q8N695 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A8Q8N695 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A8Q8N695 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A8Q8N695 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms