Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDFY3Q8IZQ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDFY3Q8IZQ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDFY3Q8IZQ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDFY3Q8IZQ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDFY3Q8IZQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDFY3Q8IZQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
WDFY3Q8IZQ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDFY3Q8IZQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDFY3Q8IZQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
WDFY3Q8IZQ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDFY3Q8IZQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms