Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVX7

NCCRP1, F-box only protein 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCCRP1Q6ZVX7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCCRP1Q6ZVX7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCCRP1Q6ZVX7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCCRP1Q6ZVX7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCCRP1Q6ZVX7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCCRP1Q6ZVX7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCCRP1Q6ZVX7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCCRP1Q6ZVX7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms