Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00299Q6ZSB3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00299Q6ZSB3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00299Q6ZSB3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00299Q6ZSB3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00299Q6ZSB3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00299Q6ZSB3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00299Q6ZSB3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms