Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UQCC3Q6UW78 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UQCC3Q6UW78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC3Q6UW78 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UQCC3Q6UW78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UQCC3Q6UW78 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UQCC3Q6UW78 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UQCC3Q6UW78 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCC3Q6UW78 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms