Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ28

PLET1, Placenta-expressed transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLET1Q6UQ28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLET1Q6UQ28 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLET1Q6UQ28 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLET1Q6UQ28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLET1Q6UQ28 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLET1Q6UQ28 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLET1Q6UQ28 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLET1Q6UQ28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLET1Q6UQ28 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms