Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD4Q6NW29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD4Q6NW29 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD4Q6NW29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD4Q6NW29 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD4Q6NW29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD4Q6NW29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD4Q6NW29 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD4Q6NW29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD4Q6NW29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RWDD4Q6NW29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RWDD4Q6NW29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RWDD4Q6NW29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RWDD4Q6NW29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RWDD4Q6NW29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RWDD4Q6NW29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RWDD4Q6NW29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RWDD4Q6NW29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RWDD4Q6NW29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms