Protein–RNA interactions for Protein: Q63HR2

TNS2, Tensin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS2Q63HR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNS2Q63HR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNS2Q63HR2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNS2Q63HR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNS2Q63HR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNS2Q63HR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNS2Q63HR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNS2Q63HR2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNS2Q63HR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS2Q63HR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS2Q63HR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS2Q63HR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNS2Q63HR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNS2Q63HR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNS2Q63HR2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNS2Q63HR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNS2Q63HR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNS2Q63HR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNS2Q63HR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNS2Q63HR2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNS2Q63HR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNS2Q63HR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNS2Q63HR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNS2Q63HR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNS2Q63HR2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNS2Q63HR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNS2Q63HR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNS2Q63HR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNS2Q63HR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TNS2Q63HR2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TNS2Q63HR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNS2Q63HR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNS2Q63HR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms