Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRCH2Q5VUJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRCH2Q5VUJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRCH2Q5VUJ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRCH2Q5VUJ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LRCH2Q5VUJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LRCH2Q5VUJ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LRCH2Q5VUJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LRCH2Q5VUJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LRCH2Q5VUJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRCH2Q5VUJ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRCH2Q5VUJ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRCH2Q5VUJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRCH2Q5VUJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRCH2Q5VUJ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRCH2Q5VUJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRCH2Q5VUJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRCH2Q5VUJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms