Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PXDC1Q5TGL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PXDC1Q5TGL8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PXDC1Q5TGL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PXDC1Q5TGL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PXDC1Q5TGL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms