Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAP1Q5SW96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAP1Q5SW96 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAP1Q5SW96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAP1Q5SW96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LDLRAP1Q5SW96 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAP1Q5SW96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAP1Q5SW96 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LDLRAP1Q5SW96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LDLRAP1Q5SW96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDLRAP1Q5SW96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDLRAP1Q5SW96 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LDLRAP1Q5SW96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAP1Q5SW96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAP1Q5SW96 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms