Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PYDC2Q56P42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PYDC2Q56P42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYDC2Q56P42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC2Q56P42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYDC2Q56P42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYDC2Q56P42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYDC2Q56P42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYDC2Q56P42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms