Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD39Q53RE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD39Q53RE8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD39Q53RE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms