Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDCA8Q53HL2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CDCA8Q53HL2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDCA8Q53HL2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CDCA8Q53HL2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CDCA8Q53HL2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CDCA8Q53HL2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CDCA8Q53HL2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CDCA8Q53HL2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CDCA8Q53HL2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CDCA8Q53HL2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDCA8Q53HL2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CDCA8Q53HL2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CDCA8Q53HL2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CDCA8Q53HL2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDCA8Q53HL2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CDCA8Q53HL2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CDCA8Q53HL2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDCA8Q53HL2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDCA8Q53HL2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CDCA8Q53HL2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDCA8Q53HL2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDCA8Q53HL2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
CDCA8Q53HL2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CDCA8Q53HL2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CDCA8Q53HL2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CDCA8Q53HL2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CDCA8Q53HL2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms