Protein–RNA interactions for Protein: Q53H76

PLA1A, Phospholipase A1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA1AQ53H76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLA1AQ53H76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA1AQ53H76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA1AQ53H76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLA1AQ53H76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLA1AQ53H76 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PLA1AQ53H76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms