Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED5Q49AG3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED5Q49AG3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZBED5Q49AG3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED5Q49AG3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBED5Q49AG3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED5Q49AG3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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