Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KIAA1644Q3SXP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIAA1644Q3SXP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIAA1644Q3SXP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KIAA1644Q3SXP7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KIAA1644Q3SXP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1644Q3SXP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA1644Q3SXP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms