Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSMPQ1L6U9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSMPQ1L6U9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSMPQ1L6U9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSMPQ1L6U9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSMPQ1L6U9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSMPQ1L6U9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSMPQ1L6U9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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