Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF239Q16600 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF239Q16600 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF239Q16600 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF239Q16600 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF239Q16600 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF239Q16600 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF239Q16600 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF239Q16600 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF239Q16600 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF239Q16600 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF239Q16600 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF239Q16600 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF239Q16600 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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