Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RYR3Q15413 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RYR3Q15413 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RYR3Q15413 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RYR3Q15413 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RYR3Q15413 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RYR3Q15413 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RYR3Q15413 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RYR3Q15413 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RYR3Q15413 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RYR3Q15413 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RYR3Q15413 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms