Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AP3B2Q13367 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AP3B2Q13367 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AP3B2Q13367 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
AP3B2Q13367 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AP3B2Q13367 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
AP3B2Q13367 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
AP3B2Q13367 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
AP3B2Q13367 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AP3B2Q13367 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
AP3B2Q13367 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
AP3B2Q13367 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
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