Protein–RNA interactions for Protein: Q13045

FLII, Protein flightless-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLIIQ13045 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FLIIQ13045 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FLIIQ13045 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FLIIQ13045 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FLIIQ13045 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FLIIQ13045 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FLIIQ13045 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FLIIQ13045 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
FLIIQ13045 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FLIIQ13045 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FLIIQ13045 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FLIIQ13045 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FLIIQ13045 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FLIIQ13045 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FLIIQ13045 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FLIIQ13045 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FLIIQ13045 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FLIIQ13045 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms