Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRN3Q13033 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
STRN3Q13033 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STRN3Q13033 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRN3Q13033 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STRN3Q13033 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STRN3Q13033 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRN3Q13033 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STRN3Q13033 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STRN3Q13033 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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