Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1EQ12965 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1EQ12965 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1EQ12965 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1EQ12965 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1EQ12965 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYO1EQ12965 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYO1EQ12965 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYO1EQ12965 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYO1EQ12965 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYO1EQ12965 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1EQ12965 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1EQ12965 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms