Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF2Q12933 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF2Q12933 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF2Q12933 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAF2Q12933 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF2Q12933 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF2Q12933 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAF2Q12933 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF2Q12933 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF2Q12933 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms