Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FLI1Q01543 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FLI1Q01543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLI1Q01543 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FLI1Q01543 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FLI1Q01543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FLI1Q01543 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FLI1Q01543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FLI1Q01543 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FLI1Q01543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FLI1Q01543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FLI1Q01543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms