Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MDM2Q00987 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MDM2Q00987 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MDM2Q00987 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MDM2Q00987 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MDM2Q00987 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MDM2Q00987 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MDM2Q00987 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MDM2Q00987 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MDM2Q00987 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms