Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM3P98179 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM3P98179 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM3P98179 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM3P98179 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM3P98179 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM3P98179 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM3P98179 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM3P98179 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RBM3P98179 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM3P98179 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBM3P98179 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM3P98179 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM3P98179 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM3P98179 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM3P98179 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RBM3P98179 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBM3P98179 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM3P98179 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBM3P98179 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM3P98179 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM3P98179 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBM3P98179 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM3P98179 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM3P98179 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBM3P98179 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBM3P98179 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBM3P98179 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM3P98179 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBM3P98179 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM3P98179 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBM3P98179 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBM3P98179 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM3P98179 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBM3P98179 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM3P98179 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM3P98179 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM3P98179 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBM3P98179 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM3P98179 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBM3P98179 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBM3P98179 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBM3P98179 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBM3P98179 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RBM3P98179 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBM3P98179 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBM3P98179 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM3P98179 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM3P98179 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM3P98179 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM3P98179 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM3P98179 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM3P98179 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM3P98179 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM3P98179 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM3P98179 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM3P98179 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM3P98179 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM3P98179 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM3P98179 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBM3P98179 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM3P98179 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM3P98179 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBM3P98179 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RBM3P98179 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBM3P98179 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBM3P98179 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBM3P98179 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBM3P98179 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBM3P98179 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBM3P98179 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBM3P98179 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBM3P98179 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBM3P98179 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBM3P98179 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBM3P98179 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBM3P98179 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBM3P98179 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBM3P98179 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBM3P98179 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBM3P98179 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBM3P98179 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBM3P98179 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBM3P98179 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBM3P98179 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBM3P98179 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBM3P98179 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBM3P98179 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBM3P98179 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBM3P98179 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBM3P98179 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBM3P98179 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBM3P98179 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM3P98179 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBM3P98179 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM3P98179 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBM3P98179 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM3P98179 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM3P98179 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBM3P98179 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms