Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL6P80162 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL6P80162 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL6P80162 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL6P80162 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CXCL6P80162 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCL6P80162 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms